Nacido en México e hijo de una pareja de españoles, Javier Aguirre es hoy el entrenador oficial de la Selección Mexicana. Fue miembro de diversos equipos como El aztecas de Los Ángeles, el club América, el Club de Fútbol Atlante, Osasuna y el Club Deportivo de Guadalajara.

En 1986 por su buen desempeño formó parte de la Selección Mexicana durante el mundial de México. Fue hasta 1994, cuando recién se retiraba que recibió una invitación de Miguel Mejía Barón ofreciéndole el puesto de Asistente, para el Mundial de Estados Unidos. Ese fue el inicio de su carrera como entrenador oficial.

En 1995 haciendo oficial el título de entrenador con el equipo Atlante, Aguirre demostró su talento salvando al equipo de su descenso, pero no conforme dos años más tarde viajó a España para seguir preparándose.

A su regreso en 1998 dirigió al Pachuca y en el año 2001 es contratado para dirigir a la Selección Mexicana logrando así su clasificación para el 2002, sin embargo sus logros no le eran suficientes por lo que volvió a regresar al equipo español Osasuna, mismo que llevó a coronarse como campeón de la Copa del Rey y la Copa de la UEFA en la temporada 2005 - 2006. Aguirre fue denominado como el mejor entrenador del equipo Osasuna.

A lo largo de su trayectoria Javier Aguirre, por su buen desempeño como entrenador, ha obtenido diversos reconocimientos en el deporte como el Premio Nacional del Deporte en México y Mejor Director Técnico del Año en España. Estos logros son el resultado del buen manejo que le ha dado a su equipo Osasuna logrando a través de él 102 victorias y 72 empates.

Sin entrar en detalles y con la breve mención de sus triunfos deportivos en territorio Español, el 3 de Abril de 2009 la Federación Mexicana de Fútbol y la Dirección General de Selecciones Nacionales anuncia el regreso de Aguirre, tomando nuevamente el puesto de Director Técnico de la Selección Mexicana.

Actualmente prepara al equipo mexicano quién jugará el partido que inaugurará el mundial Sudáfrica 2010 y que tendrá lugar el día 11 de junio del mismo año.